Air Malta tiene vuelos entre la isla principal y un gran número de ciudades europeas, así como hacia El Cairo, Dubai, Damasco y Túnez. Otras líneas aéreas con vuelos a Malta son Alitalia, KLM, Lufthansa, Swissair y Tunisavia. El aeropuerto internacional de Malta se encuentra a unos 5 km al suroeste de La Valletta. El trayecto puede hacerse en autobús, taxi o coche de alquiler.
Durante el verano, funciona un servicio de ferry entre Malta, Catania (Sicilia) y Génova (Italia). El viaje entre Malta y Catania dura unas tres horas. Todos los pasajeros que parten por mar deben pagar un impuesto de salida de diez dólares, más el 15% que cobra el Gobierno por leva.